В соответствии с Законом КР "О государственной регистрации юридических лиц, филиалов (представительств)" перед представлением документов для регистрации прекращения деятельности ОсОО в регистрирующий орган Вы обязаны были в установленном порядке ликвидировать средство массовой информации.
Теперь, Вам необходимо не перерегистрировать СМИ, а заново его зарегистрировать.